Se trata de un vecindario dependiente de L’Escala , conservado como pueblo medieval. En tiempo pasado había sido una península y acogió los primeros habitantes a partir del siglo IX a. C. Tres siglos después, estableció relaciones comerciales con fenicios, púnicos y foceos masaliotas, lo que marcó el inicio de las negociaciones que hicieron de Empúries uno de los puertos más importantes del Mediterráneo. Desde entonces, Sant Martí d’Empúries ha estado siempre habitado de forma continuada.
Hasta el 1064, Sant Martí fue sede del condado de Empúries . Se conserva una buena parte de la muralla medieval . La iglesia de Sant Martí se construyó en 1538, sobre el templo prerrománico del año 926. En contraste con el carácter medieval de la población, en Sant Martí encontramos la Casa Forestal , de estilo modernista, actualmente sede de la fundación Iberia Graeca . Justo delante están los restos del antiguo castillo , que inspiró a Víctor Mora , creador del cómic Capitán Trueno , como sede residencial del héroe.
Vale la pena recorrer las calles estrechas de Sant Martí. En la plaza Mayor hay varios restaurantes con interesantes propuestas gastronómicas. Una vez visitado este núcleo, también es muy recomendable recorrer el paseo de Empúries , que une Sant Martí con el casco urbano de L’Escala. En un par de kilómetros es posible descubrir las playas de Empúries , pasar justo por el lado del yacimiento grecorromano de Empúries y ver el antiguo Moll Grec.